Фамилия Похитон — редкий случай, когда основа прозвища почти полностью сохранила свою глагольную природу. В отличие от большинства русских фамилий, образованных от существительных (Кузнецов, Смирнов) или прилагательных (Белый, Толстой), здесь в основе лежит чистое действие: «похитить». Это не имя, не ремесло и не черта характера, а конкретный поступок или даже склонность к нему.

Модель образования проста: корень «похит-» (от «похитить» — украсть, унести тайком) плюс суффикс «-он». Такая словообразовательная схема редка: обычно суффикс «-он» встречается в фамилиях украинского или белорусского происхождения (Грицон, Петрон) или в книжных, семинарских фамилиях (Платон, Аристон). В случае с Похитон скорее всего перед нами прозвище, которое дали человеку за конкретный случай — возможно, за кражу, за то, что «похитил» невесту или утащил что-то ценное. Прозвища на «-он» нередко носили оттенок пренебрежения или шутки, поэтому Похитоном могли назвать вора-неудачника или озорника.

Фамилия почти не встречается в центральных русских губерниях, её география тяготеет к юго-западу — к Украине и Белоруссии, а также к казачьим областям. В списках донских и кубанских казаков можно найти единичные упоминания Похитонов, но массового распространения фамилия не получила. Это объяснимо: прозвище с откровенно криминальным оттенком вряд ли давали при крещении, оно оставалось уличным или дворовым и редко закреплялось в документах как родовая фамилия.

В словарях русских фамилий (например, у Б. Унбегауна) Похитон отсутствует — это говорит о её крайней локальности. Сравнение с однокоренными фамилиями (Похитнев, Похитников) показывает, что все они образованы от того же корня, но с разными суффиксами. Похитон — самый архаичный вариант, сохранивший форму чистого прозвища без патронимического суффикса «-ов». Так что носитель этой фамилии может считать себя обладателем одного из редчайших «глагольных» прозвищ, которое не успело превратиться в стандартную фамилию на «-ов».