Фамилия Похомкины — это не отдельная родовая ветвь, а фонетический вариант более распространенной фамилии Пахомкины. Такое чередование гласных «а» и «о» в корне типично для русских говоров, особенно для северных и среднерусских, где аканье или, наоборот, оканье влияло на произношение и закреплялось в документах. Поэтому, ища свои корни, носителям фамилии Похомкины стоит в первую очередь изучать историю рода Пахомкиных.

В основе фамилии лежит каноническое крестильное имя Пахомий, которое пришло на Русь из Византии вместе с христианством. В переводе с греческого оно означает «широкоплечий». В повседневном обиходе это имя звучало как Пахом, а ласковое обращение к человеку — Пахомка. Именно от этой уменьшительной формы и образована фамилия: суффикс «-ин» указывает на принадлежность, то есть «сын Пахомки».

Скорее всего, основоположник рода Похомкиных появился на свет в день памяти святого с таким именем, и родители назвали его в честь небесного покровителя. В православных святцах почитается несколько мучеников Пахомиев. Один из них, согласно житийной литературе, пострадал за веру в XVIII веке: в 1780 году он был обезглавлен за отказ принять мусульманство. Это предание, возможно, и легло в основу народных рассказов о происхождении фамилии, хотя само имя было известно на Руси задолго до этой даты — его носили многие святые и простые люди.

Модель образования фамилии проста и понятна: от личного имени отца через притяжательный суффикс. Сначала Пахомку или Похомку в деревне называли «Похомкин сын», а затем это прозвание закрепилось за всей семьей и стало передаваться по наследству. Так потомок человека по имени Пахомка со временем получил фамилию Похомкины.

Безусловно, фамилия Похомкины — заметный памятник славянской культуры, сохранивший в себе древнее имя и особенности народной речи. Однако процесс формирования каждой отдельной фамилии мог быть длительным и не всегда имел привязку только к одной местности. Окончательно говорить о точном времени и месте происхождения именно этой ветви рода можно лишь на основании серьезных генеалогических исследований, изучения архивных документов и метрических книг конкретных губерний.