Фамилия Пологенький — редкий случай, когда в основе прозвища лежит не профессия или внешность, а характеристика местности или предмета, данная через уменьшительно-ласкательный суффикс. Корень здесь — «полог», то есть покатый склон, отлогий берег или наклонная поверхность. В русских говорах «пологий» означало «не крутой, плавно спускающийся». Прозвище Пологенький мог получить человек, живший у такого склона или на ровном, слегка наклонном участке земли. В этом случае фамилия — типичный топонимический отыменный вариант, где суффикс -еньк- придаёт не столько уменьшительность, сколько подчёркивает признак: «вот тот, что с пологого места».

Однако есть и вторая, менее очевидная версия. В диалектах слово «полог» могло означать занавес, навес, шатёр — то, что «положили» сверху. Прозвище Пологенький могли дать мастеру, который шил пологи (например, для кроватей или телег), или человеку, торговавшему тканями для таких занавесей. Суффикс -еньк- здесь работает как характерный для южнорусских и украинских фамилий показатель ласкательности или принадлежности: «сын Полога» или «маленький Полог». В таком случае фамилия сближается с однокоренными Пологин, Пологов, Полога, но выделяется именно экспрессивным окончанием.

С географической точки зрения фамилия Пологенький — южнорусская или украинская. Формант -енький типичен для фамилий, возникших на территории современной Украины и прилегающих областей России (Курская, Белгородская, Воронежская губернии). Встречаемость фамилии крайне низкая: по открытым данным, носителей не более нескольких сотен человек, и большинство из них сосредоточено в Краснодарском крае и Ростовской области. Это косвенно подтверждает версию о переселенческом происхождении: предки могли быть выходцами с Украины, получившими прозвище по месту жительства.

Словообразовательная модель фамилии необычна: прилагательное с суффиксом -еньк- перешло в разряд фамилий без дополнительных патронимических суффиксов (-ов, -ин). Такое прямое субстантивирование — признак более позднего закрепления прозвищ (XVII–XVIII века), когда фамилии могли фиксироваться в том виде, в каком их слышали писцы. В итоге Пологенький — это не «сын Полога», а сам человек, охарактеризованный как «пологий» или «относящийся к пологу». Это делает фамилию одновременно и простой по смыслу, и редкой по форме.