Фамилия Пологуткина — женская форма фамилии Пологуткин, и её происхождение связано с прозвищем, которое звучало необычно даже для XVI–XVII веков. В основе лежит слово «пологутка» — так в русских говорах, в частности в северных и сибирских, называли небольшой полог, занавеску или накидку. Человек мог получить прозвище Пологутка за профессию (изготовление или продажа пологов), за характерную деталь одежды или за то, что жил за пологом, в уединении.

Словообразовательная модель проста: к основе «пологутк-» добавили патронимический суффикс «-ин», который в русских фамилиях указывал на принадлежность к отцу или главе семьи. Пологуткин — буквально «сын Пологутки», то есть потомок человека, которого в округе знали под этим прозвищем. Важно, что суффикс «-утк-» в прозвище — редкий уменьшительный вариант от «полог»: это не просто «полог», а «маленький полог» или «положек», что усиливает бытовой, даже ласкательный оттенок.

Географически фамилия тяготеет к Вятке и Пермскому краю — регионам, где старые прозвища на «-утка» встречались чаще, чем в средней полосе. В документах XVII века можно найти упоминания крестьян с прозвищем Пологутка в Слободском уезде, что косвенно подтверждает непривилегированное происхождение: предки Пологуткиных, скорее всего, были государственными или монастырскими крестьянами, а не дворянами.

В отличие от фамилий, образованных от крестильных имён (Иванов, Петров), Пологуткина — яркий пример прозвищной фамилии, где за основу взяли не имя, а конкретную деталь быта или внешности. Это делает её ценной для историков повседневности: по ней можно судить, что предки носителя жили в среде, где полог был заметным предметом — либо в избе, либо в дороге (кибитка, санный возок). Других версий, например от тюркских корней, не существует: слово чисто славянское, с прозрачной этимологией.