Фамилия Понаэтов — редкий случай, когда основа читается почти как иностранное слово, но на поверку оказывается исконно русской, хоть и с необычным суффиксом. Разберём её по косточкам.

Корень здесь — «Понай» или «Пона», а суффикс «-етов» встречается в русских фамилиях нечасто. Чаще всего такие окончания появлялись в результате адаптации тюркских или греческих имён, но в данном случае, скорее всего, мы имеем дело с внутрирусским образованием. Основа могла восходить к прозвищу Понай — от глагола «понаить» (понукать, понуждать, заставлять) или от диалектного «понай» (назойливый человек). Второй вариант: от имени Пона — краткой формы канонического имени Понтий (от греческого «понтос» — море). Такие усечённые формы (Пона, Поня) в быту давали множество фамилий: Понев, Понин, Понихин.

Суффикс «-етов» мог возникнуть при оформлении фамилии от прозвища Понай через притяжательное прилагательное «Понаев» с последующим наращением «-т-» (по аналогии с фамилиями типа Иванов → Иванотов, хотя это редкий путь). Правдоподобнее, однако, что фамилия образована от отчества Понает (сын Поная), где «-ет» — диалектный или просторечный вариант суффикса «-евич» (ср. Семён → Семет, Семётов). Такие формы встречались в северных и сибирских говорах, где «-ет» заменяло полное отчество.

Географически фамилия Понаэтов (именно через «э», а не через «е») — явный признак южнорусского или украинского влияния: в этих регионах «е» под ударением часто переходило в «э» на письме (ср. Потапов и Потапов — но «э» фиксировало произношение). Встречается фамилия в единичных записях по Курской, Воронежской областям и в среде казачества.

Социальный срез: носители фамилии — скорее всего, потомки крестьян или однодворцев (государственных крестьян южных окраин). Дворянских родов с такой фамилией не зафиксировано. Прозвище Понай могло закрепиться за человеком с настойчивым, требовательным характером — того, кто «понает» (понукает) других.

Итог: Понаэтов — фамилия редкого суффиксального типа, возникшая от прозвища или отчества Понай/Понает, с южнорусским фонетическим оттенком. Её редкость — не повод для мистификаций, а просто следствие локального бытования.