По одной из версий, она восходит к латинскому слову poena, которое в переводе на русский язык означает «наказание, кара», «страдание, мучение, мука». Возможно, что фамилию Пона мог получить человек, испытавший множество трудностей. Согласно другой гипотезе, данная фамилия ведет свое начало от латинского глагола pono, имеющего ряд значений: «класть», «бросать», «сажать», «хоронить», «использовать», «делать ставку, ставить (в игре или пари)», «успокаивать». Исходя из этого, можно предположить, что фамилия Пона либо относится к «профессиональным» именованиям, содержащим указание на род занятий человека (например, могильщик или садовод), либо отражает особенности характера, поведения или привычки (страсть к азартным играм). Не исключено, что фамилия Пона происходит от испанского слова pon, которое в переводе на русский язык означает «пудинг из кукурузной муки и патоки». В таком случае родоначальник Пона либо был любителем этого блюда, либо хорошо его готовил.