Фамилия Понакшина — женская форма фамилии Понакшин. В русской традиции такие фамилии чаще всего не имеют собственного значения, а наследуют смысл мужского варианта. Поэтому главный вопрос — что стоит за основой «Понакш-».

Словообразовательная модель здесь редкая и заслуживает внимания. Суффикс -ин указывает на принадлежность: Понакшин — это «сын Понакши» или «человек из рода Понакши». А вот само прозвище Понакша — почти наверняка усечённая или диалектная форма от более полного имени или прозвища. Скорее всего, основа восходит к глаголу «понакашивать» или «понакошёвывать» — в северных и сибирских говорах так могли говорить о том, кто много и усердно косил, или, наоборот, о человеке, который «накашивает» (собирает, наживает) добро. Впрочем, есть и другая версия: «понакша» могло быть искажением от «понакошник» — так в некоторых областях называли косца, работающего на покосе.

Менее вероятно, но стоит упомянуть: корень мог быть связан с тюркскими языками, где «кош» или «кыш» означает «зимовье», «стоянка», «лагерь». Приставка «по-» в таком случае могла означать «находящийся у зимовья» или «пришедший с зимовья». Но для фамилии Понакшина эта версия слабая — слишком много допущений, и нет устойчивой фиксации таких основ в русских фамилиях.

Географически фамилия Понакшина тяготеет к Поволжью и Уралу, особенно к Пермскому краю и Кировской области. Это регионы, где были сильны старообрядческие общины и где активно шло смешение русского населения с финно-угорскими народами. В таких местах часто возникали прозвища, отражающие занятия или бытовые особенности, а не знатное происхождение.

Сословно Понакшины, скорее всего, относились к крестьянам или посадским людям. Никаких следов дворянства или известных исторических личностей с этой фамилией не зафиксировано. Это не делает её «менее интересной» — напротив, она хранит память о простом человеке, которого в деревне прозвали за характерную черту: либо за то, что он «понакашивал» больше других, либо за привычку копить и «накашивать» добро.