Фамилия Понихиденко — украинская по происхождению, и её разговорная основа сразу бросается в глаза. Это не фамилия от имени или ремесла, а от прозвища, образованного от глагола. Разбираем слово: «понихида» — это просторечная, народная форма слова «панихида» (церковная служба по умершему). Суффикс -енко, типичный для восточной Украины, означает «сын» или «потомок». Таким образом, Понихиденко — это буквально «сын того, кого прозвали Понихида».

Прозвище Понихида могли дать человеку по нескольким причинам. Самая прямая версия — профессиональная: так могли называть певчего на клиросе, чтеца псалтыри по покойникам или человека, который за плату читал панихиды. В украинских сёлах такие люди были на виду, их прозвище легко закреплялось за семьёй. Вторая, менее торжественная версия — прозвище могли дать за мрачный, «похоронный» вид, за привычку говорить нараспев или за то, что человек часто посещал кладбище. Слово «понихида» в народной речи звучало не столько сакрально, сколько бытово, и прозвище могло быть ироничным или даже дразнилкой.

Фамилия недвусмысленно указывает на церковную среду, но не на священство. Священники редко получали фамилии от панихиды — у них были фамилии по названиям храмов или праздников (Рождественский, Успенский). А вот низшие церковнослужители, дьячки и пономари, которых в народе звали «понихидниками», как раз и становились носителями такого прозвища. Поэтому предки Понихиденко с высокой вероятностью были не попами, а причётниками — людьми, которые помогали при службе, читали и пели заупокойные молитвы.

Интересно, что фамилия могла возникнуть и из другого источника. В некоторых говорах «понихидой» называли не только службу, но и саму поминальную трапезу, а также кутью или блины, которые на неё ставили. В этом случае прозвище могло достаться любителю поесть на поминках или тому, кто постоянно ходил по чужим обедам. Но эта версия менее вероятна: прозвища от обрядовых блюд встречаются реже, чем от церковных должностей.

Географически фамилия Понихиденко привязана к центральным и восточным областям Украины: Черкасской, Полтавской, Сумской, а также к югу России, куда переселялись украинцы. В списках казацких реестров XVII–XVIII веков похожих прозвищ не встречается — фамилия скорее крестьянская или мещанская, а не казацкая. Она не принадлежала к аристократии, но и не была редкой: в переписях XIX века такие фамилии встречаются регулярно, что говорит о её устойчивости в народной среде.