Фамилия Пониткова — женская форма, мужская — Понитков. Чтобы понять её происхождение, нужно взглянуть на суффикс. Окончание -ов указывает на типичную русскую патронимическую модель: «чей?» — Понитков, то есть сын Понитка. Значит, основа — прозвище или неканоническое имя Пониток.

Корень здесь — «понит-», который с высокой вероятностью восходит к глаголу «понить» или существительному «поня». В северных и сибирских говорах «поня» — это вид грубой домотканой одежды, род понёвы (юбки) или рабочего халата. Человека могли прозвать Пониток за то, что он носил такую одежду, шил её или торговал ею. Суффикс -ок в прозвище уменьшительный, но не обязательно ласкательный — он мог означать «малый, молодой» или просто быть характерным окончанием для прозвищ на Севере (сравните: Вязок, Косток).

Есть и другая, менее очевидная версия: от слова «поня» в значении «понимание, толк». В некоторых диалектах «поня» — это «понятливый, смышлёный человек». Тогда Пониток — прозвище сообразительного или догадливого парня. Однако первая версия, с одеждой, надёжнее: профессиональные или бытовые прозвища в русской ономастике встречаются чаще, чем абстрактные.

Географически фамилия редкая, её основные следы — в центральных и северных областях России (Вологодчина, Костромская земля). Встречается и вариант Понитков, без перехода «о» в «а» под ударением. В дореволюционных переписях Понитковы числились в основном среди крестьян и мещан — ремесленников, связанных с ткачеством или портняжным делом. Таким образом, ваш предок скорее всего был человеком, которого окружающие запомнили по грубой домотканой одежде — либо он её носил, либо делал.