Фамилия Понюхно — редкий случай, когда прозвище, лёгшее в основу, сохранилось почти без изменений. В отличие от тысяч фамилий на -ов, -ин или -ский, эта образована по украинской модели с суффиксом -но, который в восточнославянской ономастике указывает на лицо, наделённое признаком, названным в корне. Прямое значение — «тот, кто нюхает» или, скорее, «тот, у кого есть привычка принюхиваться». Прозвище Понюха, Понюхно могли дать человеку с обострённым обонянием, который постоянно что-то вынюхивал, или же, в переносном смысле, любопытному, дотошному, всюду сующему нос.

Корень «нюх-» отчётливо связан с обонянием. В русских говорах слово «нюх» означало не только чутьё, но и пронырливость, смекалку. В украинском языке «нюх» — то же, что и в русском, а глагол «понюхати» — «понюхать». Фамилия Понюхно, скорее всего, закрепилась на территории современной Украины или юга России, где была распространена модель фамилий с суффиксом -но (как Потеряйко, Приходько, Поздняк). Встречается она крайне редко, что говорит о локальном происхождении: прозвище могло закрепиться за одной семьёй в конкретном селе или хуторе.

Версия о связи с нюхательным табаком маловероятна: прозвища по привычке к табаку обычно образовывались по-другому (Тютюнник, Табаков, Нюхало). Понюхно — это не про действие, а про свойство: человек, который «понюхнув» — то есть такой, что его можно охарактеризовать через нюх. Фамилия не имеет отношения к дворянским родам или известным историческим личностям — она из народной, крестьянской среды. Носители её, судя по скудным данным, встречаются в Черниговской и Сумской областях Украины, а также среди потомков переселенцев на Кубани.

С точки зрения словообразования фамилия Понюхно стоит в одном ряду с такими же редкими антропонимами, как Повитыкно, Покотило, Поморгайло. Это так называемые «прозвищные фамилии» без патронимического суффикса, которые застыли в форме, близкой к исходному прозвищу. Если вы носите эту фамилию, то с большой вероятностью ваши предки были людьми с яркой, заметной чертой характера или внешности — любопытными, дотошными, с острым чутьём.