Скорее всего, Попеков — это русифицированная польская фамилия Попек. Она, в свою очередь, образована от прозвища Поп при помощи уменьшительного польского суффикса -ек. Это прозвище ведет свое начало от аналогичного нарицательного со значением «православный священник». Так и прозвище Поп закрепилось за человеком в качестве наиболее употребительного именования, а со временем легло в основу фамилии Попеков. Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Поп, со временем получил фамилию Попеков.