Фамилия Пркудина встречается редко, и её разбор — задача не самая простая из-за неочевидной основы. На первый взгляд кажется, что перед нами вариант фамилии Прокудина, где выпала беглая гласная «о». Однако в русской ономастике такое сокращение корня нехарактерно: обычно фамилии на -ин в устной речи могли редуцироваться, но на письме сохраняли полную форму. Скорее всего, мы имеем дело с диалектным или записанным на слух вариантом.

Корень «пркуд» или «прокуд» ведёт к древнерусскому глаголу «прокудить» — проказничать, шалить, пакостить. В словарях Даля встречается слово «проказник» в значении «озорник, шалун», а «прокуда» — это и проказа, и сам проказливый человек. Таким образом, в основе фамилии лежит прозвище Прокуда, которое давали непоседливому, озорному или склонному к выходкам человеку. Фамилия Пркудина — это форма женского рода (чья? — Пркудина), то есть жена или дочь человека по прозвищу Пркуда.

Суффикс -ин указывает на типичную для северных и центральных русских земель модель образования фамилий от прозвищ и имён, оканчивающихся на -а/-я. Вероятно, фамилия закрепилась в тех регионах, где местные говоры допускали «аканье» или редукцию гласных, из-за чего «Прокуда» на слух превратилось в «Пркуда». В письменных источниках (например, в переписных книгах XVII века) встречается фамилия Прокудин, а Пркудина — её более редкая фонетическая сестра, возникшая, скорее всего, при записи фамилии со слов носителя в эпоху, когда орфография ещё не устоялась.

Если искать однокоренные фамилии, то ближайшие — Прокудин, Прокудкин, Прокушин. Все они восходят к тому же прозвищу. Но Пркудина стоит особняком: она сохранила следы живого произношения, что делает её интересным примером того, как фамилия может «законсервировать» местный говор.

Сословной принадлежности у фамилии нет: Прокуды и их потомки могли быть и крестьянами, и посадскими людьми, и казаками. В метрических книгах XIX века Пркудины изредка встречаются в Вятской и Пермской губерниях, что косвенно подтверждает северное происхождение.