Фамилия Прохацкая — одна из тех, что ставит исследователя перед загадкой. Её основа, корень «Прохац-», не встречается в древнерусских именах, прозвищах или профессиях в прямом виде. Поэтому главная гипотеза здесь — географическая, а не прозвищная.

Скорее всего, фамилия образована от названия населённого пункта. На Украине и в юго-западных областях России есть несколько сёл и хуторов с корнем «Прохац-» или «Прох-» (например, Прохоровка, Прохоры). Если предположить, что предок носителя фамилии был выходцем из места вроде Прохачи или Прохацкого, то фамилия Прохацкая — это типичная «топонимическая» фамилия, указывающая на «откуда родом». Модель образования проста: от названия села (Прохачи) с помощью суффикса -ц- и окончания -кая, что характерно для фамилий польского или украинского происхождения. В польской ономастике суффикс -цкий (-ский) часто прикреплялся к названиям мест, оканчивающимся на -а, -о (Prochacz → Prochacki). Русская форма Прохацкая — это адаптация этой модели.

Менее вероятная, но возможная версия — связь с прозвищем. В южнорусских и украинских говорах слово «прохач» могло означать просителя, нищего или того, кто «прохает» (просит). Однако прозвище «Прохач» известно в документах, но фамилия от него чаще выглядела бы как Прохачев или Прохаченко. Форма на -цкая указывает именно на «шляхетский» или «землевладельческий» оттенок — такие фамилии в XVII-XIX веках часто получали переселенцы из Польши или Западной Украины, записываясь по месту выхода.

Фамилия редкая. Её носительницы, как правило, встречаются на западе России, в Беларуси и на Украине. Сословно предки Прохацких могли быть как крестьянами, переселившимися из одного поместья в другое, так и мелкими шляхтичами, потерявшими документы на дворянство. Точных данных о дате первого упоминания нет — в открытых источниках фамилия не фигурирует в боярских книгах или ревизских сказках центральных губерний, что подтверждает её «окраинное» происхождение.