Фамилия Птрахин — редкий случай, когда трудность начинается уже с первого взгляда. Сочетание «птр» в начале слова для русского языка нетипично, и это сразу подсказывает, что перед нами не исконно русская основа, а результат фонетических изменений. Скорее всего, исходное слово звучало иначе, а при освоении говорами или при записи в документах потеряло один звук или изменило его.

Самая вероятная версия — фамилия образована от прозвища или имени Птрах, которое, в свою очередь, восходит к крестильному имени Петр. В русских диалектах и просторечии имя Петр нередко сокращалось до Петра, Петруха, Петряй, а в некоторых говорах — до Пётрах или Птрах. Утрата начального гласного «е» (Пётр → Птр) — явление нечастое, но возможное в условиях быстрой речи или при записи фамилии малограмотным писарем, который записал звучание на слух. Суффикс -ин указывает на принадлежность: Птрахин — сын Птраха, то есть потомок человека по прозвищу Птрах (Петр).

Менее убедительна, но теоретически возможна связь с диалектным словом «птрах» — так в некоторых областях могли называть птицу (например, перепела или тетерева, от звукоподражания «птр-птр»). Однако документальных подтверждений этому нет, и версия с именем Петр выглядит гораздо логичнее, учитывая массовость фамилий от календарных имён.

Встречаемость фамилии крайне низкая. В современных базах данных Птрахины фиксируются в единичных случаях, преимущественно в центральных и южных регионах России. Это говорит о том, что фамилия могла возникнуть в одной локальной группе и не получила широкого распространения. Сословная принадлежность предков, скорее всего, крестьянская или мещанская — такие «урезанные» формы имён чаще встречались в среде, где документы велись небрежно, а имя сокращалось до обиходного прозвища.