Фамилия Пухарт образована от аналогичного прозвища Пухарт, которое восходит к эстонскому слову puhas - «безгрешный, девственный, незапятнанный, непорочный». Согласно этому, прозвище Пухарт мог получить высоконравственный человек. Менее вероятно, что прозвище Пухарт образовано от белорусского слова пухір — «пузырь». В таком случае, Пухарем могли прозвать полного, пузатого, толстого человека. Возможно также, что это прозвище фамилия связано с профессиональной деятельностью предка (он мог быть стеклодувом).