В основе фамилии Пушилин лежит прозвище Пушила, которое мог получить человек с пышными волосами, либо торговец мехами, пушниной. Веселовского упоминается однокоренные фамилии: Пух Иван Васильевич Тетерин, дьяк, 1538-1549 гг.; его сын Тимофей Пухов, известный эмигрант времен Ивана Грозного. Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Пушила, со временем получил фамилию Пушилин.