Фамилия Пузыр — редкий случай, когда прозвище перешло в фамилию почти без изменений, без типичных фамильных суффиксов -ов, -ев или -ин. В русской традиции такие «голые» фамилии чаще встречались на Украине и в Белоруссии, но и в России они бытовали, особенно в крестьянской среде. Форма Пузыр — это прямая фиксация прозвища, которое человек носил при жизни.

Прозвище Пузыр, скорее всего, дали человеку с заметной внешностью: полному, круглолицему или низкорослому, с пухлыми щеками. Называли так и обидчивого, «надутого» человека, который легко обижался и «пузырился» от злости. В некоторых говорах «пузырём» называли также лягушку или водяной пузырёк на воде, но антропонимическая логика чаще отталкивается от человеческих качеств, а не от животных.

Интересно, что в старых документах эта фамилия могла писаться и как Пузырь — с мягким знаком на конце. В украинском языке форма Пузыр (без мягкого знака) более характерна для западных регионов, а в русских переписях XVII–XVIII веков встречаются оба варианта, иногда даже у одной семьи в разных записях. Разница в написании не меняла сути: прозвище оставалось тем же.

Однокоренные фамилии — Пузырев, Пузырёв, Пузырко — встречаются гораздо чаще. Они образованы по стандартной модели: к основе Пузыр- добавили суффикс принадлежности -ев. Фамилия Пузыр без суффикса сохранилась в меньшинстве, и её носители — это, как правило, потомки тех, чьё прозвище в момент становления фамилии не успели или не захотели «русифицировать» суффиксом.

По сословной принадлежности сказать что-то определённое сложно: Пузыри встречались и среди крестьян, и среди казаков, и в мещанской среде. Географически фамилия плотнее всего зафиксирована на юге России, в Белгородской, Воронежской областях, а также в Белоруссии. В дворянских родословных книгах эта фамилия не отмечена — это народная, бытовая фамилия без аристократической истории.