Фамилия Пыняев — редкий пример того, как географический диалект сохранился в фамильном прозвище. В её основе лежит слово «пыня», которое в рязанских, тамбовских и владимирских говорах означало «гордый, спесивый, чванливый человек». Прозвище Пыня давали тому, кто «пыжится», то есть надувается от важности, держится надменно. Слово это родственно глаголу «пыжиться» и существительному «пыл» — в значении горячности, запальчивости.

Суффикс -ев указывает на типичную русскую патронимическую модель: Пыняев буквально значит «сын Пыни». Форма с -ев, а не с -ин, появилась потому, что основа «Пыня» оканчивается на мягкий согласный. Такое окончание характерно для фамилий, возникших в центральных и южнорусских областях, где прозвища на -я были особенно распространены.

Встречаются и другие варианты той же основы: Пынин, Пыньков, Пыжов. Но Пыняев стоит особняком — у него иная огласовка корня, более архаичная. В документах XVII века можно найти упоминания крестьян Пыней в Рязанском уезде, что подтверждает: прозвище бытовало в среде земледельцев и посадских людей, а не в дворянской среде. Среди дворянских родов эта фамилия не зафиксирована.

Есть и менее вероятная версия: от диалектного «пыня» — «пухлый, толстый», что тоже могло стать прозвищем по внешности. Но большинство ономастов склоняются к первой трактовке — по характеру, а не по телосложению. Так или иначе, Пыняев — фамилия, в которой слышен отголосок русской народной речи, почти исчезнувшей из повседневного обихода.