Основой фамилии Пыпина послужило мирское имя Пыпа. Мирское имя Пыпа восходит к аналогичному диалектному нарицательному. Пыпой во Владимирской области называют овсяную или ячневую муку. Известно, что в старину имена, представляющие собой названия кушаний (например, Сметана, Творог, Кисель), были очень распространены. К подобным именам может относиться и имя Пыпа. Однако в основе фамилии Пыпина может лежать не только мирское имя, но и прозвище Пыпа. Так могли прозвать пекаря или того, кто изготавливал овсяную или ячневую муку. Не исключено также, что прозвище Пыпа восходит к украинскому существительному «пипа» («пыпа»), то есть «мера вина, бочка в 40-50 ведер». Это прозвище может относиться к так называемым «профессиональным» именованиям, содержащим указание на деятельность человека. Поэтому основатель рода Пыпиных мог быть виноделом. Так, из «Ономастикона» Веселовского известны: Иван Пыпа (крестьянин, 1495 год, Новгород), Игнат Алексеев Пыпа (посадский человек, 1635 год, Можайск), Василий Пыпина (крестьянин, 1475 год, Дмитров). Таким образом, потомок человека, обладающего именем Пыпа, со временем получил фамилию Пыпина.