Фамилия Рафаилов имеет очень интересную историю происхождения и относится к распространенному типу древнейших восточных фамилий, ведущих свое начало от тюркских носителей, а именно выходцев из Золотой Орды: или от печенегов, или от половцев. Соответственно, своими корнями фамилия Рафаилов уходит в XV-XVII вв. Сведения в родословной о восточном происхождении фамилии Рафаилов являются более или менее точными и подтверждаются соответствующими восточным именем ее родоначальника. Фамилия Рафаилов образована от восточного мужского личного имени Рафаил, которое в переводе на русский язык означает «Бог вылечил». Нарекая ребенка таким именем, родители надеялись, что в будущем их отпрыск сможет показать себя настоящим мужчиной и преданным другом. Проникновению инонациональных основ в состав русских фамилий, и в частности в состав фамилии Рафаилов способствовал тот исторический факт, что многие дворяне в России были по своему происхождению нерусскими. Тем не менее, фамилия Рафаилов представляет собой замечательный памятник восточной письменности и культуры.