Фамилия Рафикова ведет свое начало от мусульманского мужского имени Рафик, которое в переводе с арабского означает «друг, товарищ, спутник», «добросердечный». Вероятно, родители, нарекая ребёнка таким именем, желали своему сыну стать настоящим мужчиной и преданным другом. Процесс формирования фамилий был достаточно длительным, поэтому окончательно говорить о точном месте и времени возникновения рода Рафиковых можно лишь на основании генеалогических исследований.