Фамилия Рогунова хранит память о прозвище дальнего предка — Рогун. Это прозвище, в свою очередь, восходит к существительному «рог», но объяснений у него несколько, и все они по-своему убедительны. Самая прямая версия — внешняя: так могли прозвать человека с круглой шишкой на лбу, которая напоминала рог. Однако прозвище часто отражало не столько внешность, сколько нрав. Рогуном могли назвать упрямца, который, как говорили, «упирается рогом в стенку», или же драчуна, имевшего обыкновение «бодаться».

Есть и третья, не менее важная версия, связанная с охотничьим бытом. Рог в старину был незаменимым спутником охотника: с помощью рога подавали сигналы, согласовывая действия участников облавы. Кроме того, рога добытого зверя считались трофеем, который украшал дом и свидетельствовал об удачливости хозяина. Поэтому вполне вероятно, что основатель рода Рогуновых был охотником, а его прозвище закрепилось за ним как самое употребительное именование.

Суффикс -ов в фамилии указывает на принадлежность: Рогунов — это сын, потомок Рогуна. Такая модель образования отчеств была самой распространённой на Руси, что делает фамилию типичной для своего времени, но с яркой, запоминающейся основой. Стоит заметить, что фамилия Рогунова — женская форма, а мужская, Рогунов, встречается чаще. В целом же фамилия относится к древнему пласту русских прозвищных фамилий, которые возникли не от церковного имени, а от живого народного слова, подмечавшего в человеке самую характерную черту.