Фамилия Рубинчикова — женская форма фамилии Рубинчиков, а та, в свою очередь, принадлежит к «профессиональной» группе русских фамилий, образованных от названий ремесленников. В основе лежит слово «рубинчик» — так в старину называли мастера, который обрабатывал рубины или торговал ими. Уменьшительный суффикс -чик здесь указывает не на мелкий масштаб, а скорее на характер деятельности: в русской ономастике суффиксы -щик/-чик активно образовывали названия лиц по занятию (ср. каменщик, стекольщик, извозчик). Соответственно, Рубинчиков — это буквально «сын рубинчика», то есть потомок ювелира или торговца драгоценными камнями.

Слово «рубин» пришло в русский язык через западноевропейские языки из латинского ruber — «красный». В России огранка и продажа рубинов были делом узких специалистов, часто выходцев из ремесленных слобод или купеческих семей. Фамилия могла возникнуть в среде посадских людей, где прозвище по ремеслу закреплялось за целым родом. Интересно, что фамилии на -ов/-ев с основой на -чик встречаются реже, чем на -щик, что делает Рубинчиковых более редким вариантом по сравнению, скажем, с Рубинщиковыми.

Встречается фамилия преимущественно в центральных регионах России и на Урале, где исторически была развита обработка камня. При этом стоит учесть, что «рубинчик» могло быть и прозвищем — например, так могли назвать человека с ярким румянцем или рыжими волосами, по ассоциации с цветом камня. Однако версия с ремеслом выглядит предпочтительнее, поскольку фамилии от названий профессий — один из самых массовых пластов русской антропонимии, а цветовые прозвища в такой суффиксальной форме встречаются редко.