Фамилия Рукисова — редкий случай, когда географическая привязка оказывается едва ли не важнее лингвистического разбора. С первого взгляда бросается в глаза нетипичный суффикс -исов. В русской фамильной модели он почти не встречается: стандартные форманты — -ов/-ев, -ин, -ский. Суффикс -исов явно указывает на нерусское, скорее всего, тюркское происхождение. В татарском, башкирском, казахском языках фамилии на -ов образуются от имён, оканчивающихся на твердый согласный, но основа «Рукис» — нехарактерна для славянского именника. Вероятнее всего, в основе лежит мужское личное имя Рукис (или Рукися), которое могло быть вариантом арабского имени Рукия (в значении «возвышенная», «духовная») или производным от тюркского рук (рука, ладонь) с добавлением аффикса принадлежности.

Поскольку фамилия крайне редкая, её география сужается до нескольких регионов. Наибольшая концентрация носителей фиксируется в Оренбургской области и Башкортостане — территориях исторического расселения татар, башкир и казахов. Это подтверждает версию о тюркском корне. Предок-носитель фамилии, скорее всего, был мусульманином, и его имя Рукис (или Рукися) со временем обросло русским патронимическим суффиксом -ов при переходе в православную или светскую среду, либо при фиксации фамилии в документах Российской империи. Второй, менее вероятный вариант — искусственное происхождение: фамилию могли дать в семинарии от латинского manus (рука) или греческого cheir, но для этого понадобилась бы цепочка преобразований, не оставившая следов в языке.

Фамилия Рукисова невелика по числу носителей, но зато компактна и не затерялась в массе однотипных окончаний. Её уникальность — в том, что она сохранила редкую основу, которая не вписалась ни в славянские прозвищные традиции, ни в типовые тюркские модели. Если ваши предки носили эту фамилию в Оренбуржье или Башкирии, скорее всего, они были татарами или башкирами, а имя Рукис передавалось по мужской линии как родовое. В других регионах фамилия встречается единично и, вероятно, является результатом миграции одной семьи.