Фамилия Рытко образована от прозвища Рыток, и у этого прозвища есть две основные версии происхождения. Первая связывает его с прилагательным «рытый» — то есть «рябой», «веснушчатый» или «со следами оспы на лице». В таком случае прозвище указывало на внешность предка: так могли назвать человека с заметными следами болезни на коже. Вторая версия отталкивается от общеславянского корня «рыть» со значением «копать». Тогда Рытком называли того, кто копал колодцы, или просто земледельца, чья работа связана с землёй.

У глагола «рыть» есть и диалектные оттенки, которые тоже могли лечь в основу прозвища. В костромских говорах он означал «трогать», в архангельских — «бросать, откидывать». Это расширяет круг возможных занятий или привычек человека, получившего такое прозвище, хотя обе книжные версии — про внешность и про копание — выглядят более убедительными.

Сама форма Рытко — это не фамилия в привычном виде с суффиксом -ов или -ин, а застывшее прозвище, которое со временем стало наследственным именем. Такое случалось часто: прозвище, данное человеку в быту, полностью вытесняло его крестильное имя и в повседневной речи, и в официальных документах. Поэтому носитель фамилии Рытко, скорее всего, потомок человека, которого окружающие знали именно по этой характерной черте — внешней или связанной с ремеслом.