Фамилия Сабодан — редкий случай, когда географический акцент помогает понять происхождение быстрее, чем морфологический разбор. Если отбросить суффикс -ан, который в восточнославянских фамилиях часто указывает на украинское или белорусское происхождение (сравните: Гайдан, Степан), остаётся основа «Сабод». Она почти наверняка восходит к фамилии Сабода, которая, в свою очередь, является фонетическим вариантом более известной Сабада — украинской формы имени Савватий или Савва. В украинском языке аканье (произношение «о» как «а» в безударной позиции) нехарактерно, но в юго-западных говорах и под влиянием польского языка встречается замена «а» на «о» в заимствованных именах. Так что Сабодан — это «сын Сабоды», то есть потомок человека по имени Савва или Савватий.

Вторая, менее очевидная версия, связывает фамилию с прозвищем от польского «sobota» (суббота) через форму «собода». В польских говорах «о» могло перейти в «а» под влиянием местных диалектов, а суффикс -ан добавил значение «относящийся к субботе» — возможно, так называли человека, родившегося или крещённого в субботу, либо того, кто работал по субботам в поле. Однако эта гипотеза слабее: в польской ономастике фамилия Собота (Sobota) встречается, но форма Сабодан — явно восточнославянская по модели образования.

Сословная принадлежность носителей фамилии не зафиксирована в открытых источниках, но по структуре (суффикс -ан, основа от имени) Сабодан — типичная крестьянская или казацкая фамилия Правобережной Украины или Подолья. В XIX веке такие фамилии редко встречались у дворян, зато массово фиксировались в реестрах Войска Запорожского и метрических книгах Киевской губернии. Если искать однокоренные фамилии, то ближайшие — Сабода, Сабодаш, Сабодах (с другим суффиксом), а также более редкая Сабоданчук (с патронимическим суффиксом -чук, указывающим на «малого Сабодана»). Ударение в фамилии, судя по распространённым носителям, падает на последний слог: Сабода́н.