Фамилия Сафрутины — редкий пример того, как народная речь перекроила книжное церковное имя до неузнаваемости. В её основе лежит крестильное имя Софроний, которое в переводе с греческого означает «здравомыслящий, благоразумный». Однако между исходным именем и фамилией произошло несколько превращений, каждое из которых оставило свой след в написании.

Начнём с цепочки преобразований. Полное имя Софроний в просторечии сократили до Софрон. Затем в говорах с «аканьем» — когда безударное «о» произносится и пишется как «а» — оно превратилось в Сафрон. А уже от этой формы образовали уменьшительно-ласкательную Сафрута. Звучит необычно, но для словообразования того времени это типично: суффикс -ут- придавал имени оттенок фамильярности и принадлежности к семье, как, например, в именах Ванюта или Михута. Потомок человека по прозвищу Сафрута и получил отчество-фамилию Сафрутин.

Модель образования здесь классическая для русских фамилий: притяжательный суффикс -ин присоединялся к основе, оканчивающейся на гласный, и отвечал на вопрос «чей?». Сафрутин — значит «сын Сафруты». Такой тип фамилий, по наблюдениям Б. Унбегауна, был широко распространён в северорусских землях, где формы имён на -ут и -юта встречались особенно часто. Поэтому, хотя точное место возникновения фамилии мы назвать не можем, её морфология указывает скорее на северное или центральное происхождение, чем на южное.

Интересно, что имя Софроний в русской традиции давало множество производных форм: от Софрон и Софроша до более редких Софон и Сафон. Фамилия Сафрутин стоит в этом ряду особняком — она сохранила не просто сокращение, а именно ласкательную форму, которая в официальные документы попадала реже, чем стандартные варианты. Это говорит о том, что предки носителей фамилии были людьми, которых в быту называли тепло и коротко, и это прозвище закрепилось за их родом прочнее, чем полное церковное имя.

О времени возникновения фамилии можно сказать лишь приблизительно. Основная масса русских фамилий, особенно от неканонических и уменьшительных форм имён, оформилась в XV–XVII веках, когда закреплялась наследственная передача прозвищ. Но Сафрутины могли появиться и позже, в среде крестьянства, где фамилии окончательно устоялись только к XIX веку. Сложно говорить и о географии: фамилия редкая, в общероссийских справочниках она не значится среди массовых, что делает её ещё более ценным свидетельством живой народной традиции имянаречения.