Фамилия Салапонова хранит память о происхождении человека, передаваясь из поколения в поколение. Скорее всего, она представляет собой фонетический вариант фамилии Шалапонов, которая образована от прозвища Шалапон. Это прозвище, в свою очередь, происходит от слова «шалапай» — так называли рослого, нескладного человека. Поэтому вполне вероятно, что прозвище Шалапон указывало на особенности внешности предка, и потомок человека с таким прозвищем со временем получил фамилию Салапонов.

Менее вероятно, что фамилия Салапонова образована от прозвища Салапон, которое восходит к украинскому нарицательному «салоп» — верхней женской одежде в виде длинной накидки с прорезами для рук. В таком случае основатель рода мог заниматься изготовлением такой одежды. Однако эта версия уступает первой: слово «салоп» в значении одежды не так часто становилось основой для прозвищ, а вот «шалапай» — распространённое в народной речи слово, которое легко закреплялось за человеком как наиболее употребительное именование.

Смена начального «ш» на «с» в фамилии — явление нередкое. Такой фонетический сдвиг мог произойти под влиянием диалектного произношения или при записи фамилии чиновниками, которые слышали её на слух и фиксировали по-своему. В итоге фамилия Салапонов закрепилась как самостоятельная, хотя её корни ведут к прозвищу Шалапон и слову «шалапай».