Фамилия Самущенков — один из тех случаев, когда русская фамилия хранит в себе имя, которое давно вышло из обихода. В её основе лежит каноническое имя Самуил (древнееврейское «услышанный Богом»), но не напрямую, а через уменьшительно-ласкательную форму Самуща. Такие сокращения — Самуня, Самуха, Самуша — были обычны в крестьянской и мещанской среде XIX века, где полное имя звучало слишком торжественно.

Модель образования проста и типична для восточнославянских фамилий: суффикс -енк- (украинского или южнорусского происхождения) указывал на «маленького», «сына» или «подмастерья» — в данном случае Самущенок, то есть сын или потомок Самущи. Финальный суффикс -ов превратил украинскую по звучанию форму в русскую фамилию, адаптировав её к стандартной модели склонения. Получается цепочка: Самуил → Самуща → Самущенок → Самущенков.

Географически фамилия тяготеет к южным областям России и, вероятно, к пограничью с Украиной — Брянской, Курской, Белгородской землям, где были распространены фамилии на -енко, позже русифицированные добавлением -ов. Встречается она нечасто, что говорит о локальном бытовании: род мог происходить из одного села или волости, где прозвище Самущенок закрепилось за целой семьёй.

Интересная деталь: в некоторых говорах имя Самуил произносили как «Самуйла», и от него образовывали форму «Самуйща» — с чередованием й/щ. Однако в фамилии Самущенков мы видим именно вариант с твёрдым «у», без йотации, что указывает на более книжное, церковное произношение исходного имени. Предок носителя фамилии, скорее всего, был простым человеком, которого в быту звали Самущей, и это прозвище перешло к детям как родовое имя.