Фамилия Самышова — женская форма фамилии Самышов, и её происхождение напрямую связано с мужским прозвищем или именем Самыш, которое легло в основу. В русской антропонимике фамилии на -ов/-ев образуются от названий, оканчивающихся на согласный или -о, и модель здесь классическая: основа Самыш- плюс патронимический суффикс -ов, указывающий на принадлежность («сын Самыша»).

Корень Самыш- — самый интересный и неочевидный элемент. В русских говорах и диалектах слово «самыш» не зафиксировано как общеупотребительное, поэтому здесь возможны две основные версии. Первая: это вариант имени Самуил или его просторечной формы Самойло — через чередование звуков и редукцию гласных. Вторая, более правдоподобная: прозвище Самыш могло образоваться от глагола «самшить» или «самыкать» (в некоторых северных и сибирских говорах — «говорить невнятно, мямлить»). Тогда прозвище дали человеку с неспешной, тягучей речью или, наоборот, с привычкой бормотать себе под нос.

Географически фамилия Самышов встречается нечасто, но её следы прослеживаются в Поволжье и на Урале — в зоне активного смешения русских говоров с финно-угорскими и тюркскими языками. Не исключено, что основа могла быть заимствована из какого-либо местного наречия: например, в марийском языке «самыш» означает «ум, разум», что могло стать прозвищем для смышлёного человека. Однако эта версия менее распространена, так как фамилия в целом остаётся в рамках русской словообразовательной модели.

С точки зрения социального контекста, Самышовы, скорее всего, были крестьянами или посадскими людьми — фамилия не дворянская, не княжеская и не семинарская (нет характерных суффиксов -ский или -ин). В документах XVII–XVIII веков такая фамилия могла появиться как уличное прозвище, которое затем закрепилось за родом. Сегодня носители фамилии Самышова — это потомки тех, кого когда-то назвали Самышем, и точное значение прозвища уже не восстановить без генеалогических изысканий в конкретной местности.