Фамилия Самышев — один из тех случаев, когда за привычным звучанием стоит неочевидная основа. На первый взгляд, корень «сам» наталкивает на мысль о прозвище «Самыш» — человека самостоятельного, себе на уме. Однако более убедительная версия лежит в области тюркских языков. В казахском, башкирском и татарском языках слово «самыш» (или «самыр») означает «запас», «богатство», а также «зажиточный, бережливый хозяин». С учетом того, что фамилии на -ев часто формировались у народов Поволжья и Приуралья, вполне вероятно, что Самышевы — это потомки человека, которого прозвали за хозяйственность или достаток.

Суффикс -ев указывает на русскую модель образования фамилий от основ, оканчивающихся на мягкий согласный или шипящий. Если бы фамилия происходила напрямую от слова «сам», мы бы скорее увидели вариант Самышев от прозвища Самыш (сравните с фамилиями Кузнецов, но Бондырев). Именно это сочетание тюркского корня с русским патронимическим суффиксом — главная особенность Самышева. Фамилия не слишком распространена, встречается в основном в регионах с историческим татарским и башкирским влиянием: в Башкортостане, Татарстане, Оренбургской и Челябинской областях.

В некоторых диалектах «самыш» могло быть искажением имени Самуил или Семён (через формы Самыл, Самыш), но это менее вероятно: для таких случаев типичны фамилии Самылов, Самуилов. Версия с тюркским «запасом» выглядит куда органичнее, особенно если учесть, что в тех же краях бытуют фамилии Самырбаев, Самырханов с тем же корнем.

Таким образом, предок современных Самышевых, скорее всего, был человеком зажиточным или просто запасливым — его прозвище закрепилось за родом, перейдя в официальную фамилию. Других достоверных сведений о древности рода или его дворянском происхождении нет.