Фамилия Сапотькина — женская форма фамилии Сапотькин. Её основа — слово «сапотка», которое в русских говорах (особенно южных и западных) означало «сапожок» или «небольшой сапог». Чаще всего так называли либо короткую обувь — полусапожки, либо, в переносном смысле, человека небольшого роста, щуплого, которого прозвали Сапоткой в шутку, за «мелкость» или за то, что он носил такую обувь.

Словообразовательная модель здесь простая и характерная для русских фамилий: прозвище Сапотка → притяжательное прилагательное с суффиксом -ин («чей?» — Сапотькин сын) → фамилия Сапотькин. Суффикс -ин указывает на принадлежность к роду конкретного человека, а не на географическую привязку, как, например, -ский. В основе лежит не имя, а именно прозвище — это типично для фамилий, связанных с ремеслом или внешностью.

Есть и вторая, менее вероятная версия: связь с украинским или белорусским словом «сапотка» — так в некоторых регионах называли не сапог, а вид корзины или лукошка. Тогда прозвище мог получить корзинщик или торговец такими изделиями. Однако обувная версия встречается в ономастических работах чаще: она естественнее для прозвища, которое легко прилипает к человеку по внешнему признаку.

Фамилия редкая, в основном встречается в центральных и южных областях России, а также в Беларуси. В дореволюционных переписях носители Сапотькиных фиксировались среди крестьян и мещан — сословной элиты среди них не было. В советское время фамилия не исчезла, но осталась малочисленной, что делает её интересной для генеалогического поиска: круг потенциальных родственников узок, а корни прослеживаются довольно чётко.