Фамилия Сапожкина образована от прозвища или ремесленного имени Сапожок. В основе лежит слово «сапожок» — уменьшительное от «сапог». На первый взгляд кажется, что предок носительницы этой фамилии был сапожником, но здесь есть тонкость. Суффикс -ок в прозвище мог указывать не на мастера, а на человека, который носил маленькие или необычные сапоги, либо на того, кто постоянно ходил в сапогах (в крестьянской среде это было редкостью, чаще носили лапти). Прозвище Сапожок могли дать и низкорослому человеку — в насмешку, по контрасту с большими сапогами.

Словообразовательная модель типична для русских фамилий: основа на согласный (Сапожок) плюс суффикс -ин, указывающий на принадлежность. Буквально: «чей?» — Сапожкина, то есть дочь или жена Сапожка. Ударение в фамилии обычно падает на второй слог: Сапо́жкина, хотя в некоторых говорах возможно смещение.

Интересно, что фамилия Сапожкина встречается реже, чем однокоренные Сапожников или Сапогов. Причина в том, что уменьшительная форма прозвища была менее распространена. В XIX веке носители этой фамилии фиксировались преимущественно в центральных губерниях России — Московской, Тверской, Рязанской. Среди них были как крестьяне, так и мещане, но никогда — дворяне: фамилия явно «низовая», ремесленная.

Если сравнивать с родственными фамилиями, то Сапожкина стоит ближе к прозвищному ряду (Ботинкин, Валенкин), а не к профессиональному (Сапожников). Это значит, что основатель рода мог и не шить сапоги — его так прозвали за внешность или привычку. Впрочем, окончательно разделить эти версии сегодня невозможно: в быту ремесленника часто называли по изделию, и уменьшительная форма могла быть просто ласкательной.