Фамилия Сараруй — редкий случай в русской ономастике. Её основа не славянская, и суффикс -уй сразу выдаёт нерусское происхождение. В русских фамилиях такой формант почти не встречается; он характерен для тюркских, финно-угорских и некоторых кавказских языков.

Скорее всего, Сараруй — это русифицированная запись фамилии, которая исходно звучала иначе. Наиболее правдоподобная версия связывает её с тюркским корнем «сара» — «жёлтый» или «белый» (в значении масти, цвета). Вторая часть, «руй», может восходить к тюркскому «руй» (лицо, облик) или быть искажением другого компонента, например, «уй» (дом, род) или «ар» (мужчина, человек). Таким образом, Сараруй могло означать «светлолицый» или «жёлтый дом» — прозвище по внешности или по родовому знаку.

Не исключено и происхождение от имени или прозвища Сара, распространённого у народов Поволжья и Средней Азии. В таком случае -руй — это суффикс принадлежности, указывающий на сына или потомка: «Сараруй» — «сын Сары». Подобная модель типична для марийских, чувашских или татарских фамилий, которые при записи в русских документах получали окончание -уй вместо исконного.

Географически фамилия Сараруй встречается единично, в основном в республиках Поволжья и на Урале. В дореволюционных переписях она не зафиксирована — вероятно, это поздняя русификация исходной формы, произошедшая в XX веке. Носители могли быть крестьянами или ремесленниками, но из-за редкости фамилии сословная привязка остаётся неясной.

Сравните с однокоренными фамилиями: Сараев (от имени Сарай или тюркского «сарай» — дворец), Сарычев (от тюркского «сары» — жёлтый), а также с марийскими фамилиями на -уй, например, Актуганов или Тойгузин. Сараруй стоит особняком: её корень не даёт однозначной этимологии, что типично для фамилий, возникших на стыке языковых групп.