Фамилия Сайетов — редкий случай, когда основа почти наверняка не славянская, а тюркская или арабо-тюркская, и суффикс -ов здесь лишь русифицирует иноязычное прозвище. В основе лежит слово «сайет» (варианты: саид, сеид, сейит) — почётный титул у мусульман, означающий потомка пророка Мухаммеда. В тюркских языках, особенно у татар, башкир, казахов и народов Кавказа, «сейит» или «сайет» закрепилось как имя собственное или как обозначение духовного лица из привилегированного рода.

Фамилия Сайетов характерна для татарской и башкирской среды, где фамилии на -ов образовывались от имён и прозвищ отцов. Если предка звали Сайет (или дали прозвище за принадлежность к сословию сейидов), его дети становились Сайетовыми. Суффикс -ев здесь не появился бы, так как основа заканчивается на твёрдый согласный, поэтому пишется именно -ов. Написание с буквой «а» в первом слоге — русская передача тюркского произношения, где звук мог редуцироваться или адаптироваться под акающие говоры.

Менее вероятная, но возможная версия — связь с арабским словом «саййид» (господин, повелитель), которое в тюркской среде тоже давало имена и прозвища. Встречаются варианты фамилии Саитов, Сеитов, Сейитов — они отражают разные диалектные произношения одного корня. Сайетовы, скорее всего, происходят из среды мусульманского духовенства или зажиточных крестьян, чей предок носил престижный религиозный титул. Географически фамилия тяготеет к Татарстану, Башкортостану и Оренбуржью, где такие именования фиксировались в метрических книгах и ревизских сказках.

В дореволюционной России носители фамилии не принадлежали к дворянству — титул сейида не давал прав на российское дворянство, но в своей общине такие семьи пользовались уважением. После революции фамилия не исчезла, но её носители разошлись по всей стране, сохранив редкое написание, которое сразу указывает на восточные корни.