Фамилия Сайниди — одна из тех, что выбивается из привычного ряда русских фамилий. Её финал -иди сразу выдаёт нерусское, скорее греческое происхождение. В русской ономастике такие фамилии называют «фамилиями на -иди»: они типичны для греков Приазовья и Крыма, а также для понтийских греков, переселявшихся в Российскую империю в XVIII–XIX веках. Суффикс -иди (или -оглу у турок) в греческом языке образует патронимическую форму, то есть фамилию по отцу: «сын такого-то». Так что Сайниди буквально означает «сын Сайни» или «потомок Сайни».

Основа фамилии — Сайни — скорее всего, восходит к греческому имени или прозвищу. Здесь возможны две версии. Первая: от греческого имени Саввас (Савва) через диалектную форму Сайнис, где произошло упрощение или переогласовка. Вторая: от турецкого или арабского слова, вошедшего в греческий язык, например, от «сайын» (уважаемый, почётный) или от личного имени Саин (в значении «добрый, хороший»). В любом случае, это именно прозвище или уменьшительное имя, которое закрепилось за родоначальником.

Географически фамилия Сайниди встречается в местах компактного проживания греков на юге России и Украины: в Донецкой, Запорожской областях, в Краснодарском крае, а также в Греции и среди греческой диаспоры. В дореволюционных метрических книгах Мариуполя, Таганрога и окрестных сёл можно найти записи о Сайниди — это были в основном ремесленники, торговцы, рыбаки. Сословно — мещане или крестьяне, реже купцы.

Интересно, что в русском языке фамилия не склоняется в мужском роде, как и другие греческие фамилии на -иди, -аки, -пуло. В женском роде она тоже остаётся неизменной. Это создаёт путаницу в бытовом общении, но для историка — верный маркер греческого корня. Сайниди — нечастая фамилия, и её носители, как правило, хорошо помнят о своих понтийских предках, даже если давно обрусели.