Фамилия Себикова — женская форма фамилии Себиков. В русской традиции такие фамилии чаще всего образовывали от мужского имени или прозвища с помощью суффикса -ов/-ев. Суффикс -ов указывает на принадлежность: Себиков значит «сын (или потомок) Себика». Основа здесь — «Себик», и это краткая форма какого-то полного имени.

Самый вероятный источник — тюркское имя Себик. В татарском, башкирском и других тюркских языках слово «сәбек» (себик) означает «ребёнок, дитя, малютка». Имя Себик (или Сәбик) давали младенцу как ласковое прозвище, которое затем закреплялось. Похожая модель распространена у тюркских народов: имена типа Себик, Кечек («маленький»), Балаш («дитя») часто становились фамилиями при переходе на русскую систему. Таким образом, предок-носитель фамилии Себиков мог быть татарином, башкиром или представителем другого тюркского народа, которого в семье ласково называли «малышом».

Менее вероятна, но возможна связь с диалектным русским словом «себить» — «гнуть, клонить» или «сбивать, сколачивать». В этом случае «Себик» могло быть прозвищем плотника или человека с характерной осанкой. Однако тюркская версия выглядит убедительнее, поскольку фамилия Себикова чаще встречается в Поволжье и на Урале — в зоне активных контактов русских с тюркским населением.

Фамилия редкая. В открытых источниках нет известных исторических деятелей с такой фамилией, что типично для фамилий, возникших в крестьянской или мещанской среде. При переписях XIX века фамилии часто записывали на слух, поэтому возможны варианты написания: Себиков, Себикова, Себеков.