Фамилия Сеферидина — редкий случай, когда в основе лежит не славянское имя или прозвище, а восточное, точнее — тюркское или арабо-персидское. Её строение сразу выдаёт нерусское происхождение: окончание -а, характерное для женских фамилий, и корень, не имеющий аналогов в славянской лексике. Скорее всего, перед нами русифицированная форма мужской фамилии Сеферидин, которая пришла в русский язык из тюркской среды.

Основа — мужское имя Сеферидин, которое восходит к арабскому Сафараддин (или Сафаруддин). Это сложное имя: первая часть «сафар» может означать «путешествие» или «поездка», а вторая — «дин» — переводится как «вера», «религия». В целом имя толкуют как «чистота веры» или «путник веры». В тюркских языках, особенно у татар, башкир, народов Кавказа, такие имена с компонентом «дин» были распространены. Фамилии от них образовывали по местному обычаю: к имени прибавляли русский суффикс -ов (Сеферидинов), но в разговорной речи окончание могли отсекать, оставляя форму Сеферидин. А женский вариант на -а закрепился, когда носительницей стала женщина — например, вдова или дочь.

Суффикс -ина в русских фамилиях обычно указывает на принадлежность («чей?»), но здесь он добавлен к уже готовой основе, что говорит о поздней адаптации. Географически фамилия тяготеет к регионам с тюркским населением: Татарстан, Башкортостан, возможно, Крым или Северный Кавказ. Встречается она крайне редко, поэтому носители могут быть связаны родством.

Социальный контекст прост: предки Сеферидиных — скорее всего, крестьяне или ремесленники, получившие фамилию по имени отца при переписях XIX–XX веков. Дворянских корней здесь нет — восточные имена в русскую аристократию почти не проникали. Единственная альтернативная версия — что основа связана не с «сафар», а с тюркским «сефер» (война, поход), но это менее вероятно, так как имя Сеферидин устойчиво фиксируется в мусульманских именословах именно с арабским корнем «сафар».