Фамилия Сельдербаева — редкий случай, когда основа почти наверняка восходит к тюркскому имени или прозвищу, а вот суффикс заставляет задуматься. Форма на «-ева» указывает на принадлежность: это женский вариант от мужской фамилии Сельдербаев. Мужская же фамилия образована по самой распространённой в русском языке модели — с суффиксом -ев, который присоединяется к основам, оканчивающимся на мягкий согласный или гласный. Но что скрывается за корнем «Сельдер-»?

Вероятнее всего, в основе лежит тюркское составное имя. Первая часть «Сельдер» (варианты: Селдер, Сельдир) может восходить к тюркскому «сел» — «поток», «разлив» или «сель» как природное явление. В переносном смысле так могли назвать стремительного, напористого человека. Вторая часть — «бай» — в тюркских языках означает «богач», «господин», «хозяин». Целиком имя Сельдербай могло значить «богатый как поток» или «господин стремительности». Имя «Бай» и его производные (Баймурат, Байбулат) были широко распространены у казахов, башкир, татар и других народов.

Менее правдоподобна версия о связи с немецкой фамилией Selder (от названия профессии — продавец сельди). Для такого заимствования не было ни исторических предпосылок, ни массового переселения немцев в регионы, где фамилия встречается сегодня. География бытования фамилии Сельдербаева — преимущественно Казахстан и прилегающие области России (Оренбуржье, Астраханская область). Это подтверждает тюркское происхождение.

Таким образом, предок носителей фамилии с большой долей вероятности носил личное имя Сельдербай. Со временем, при переходе в русскую документацию, имя оформили по стандартной модели: к основе Сельдербай добавили русский суффикс -ев (после гласного «й» он даёт «ев»). Фамилия закрепилась в мужском роде как Сельдербаев, а затем появился и женский вариант.