Фамилия Семакин происходит от старинного русского имени Семака — одной из обиходных форм церковного имени Симеон. В переводе с древнееврейского Симеон означает «услышанный Богом в молитве». Так что предки современных Семакиных носили имя, которое говорило о надежде на божественный отклик, и это был самый прямой путь к фамилии: Семака — сын Семаки — Семакин.

Суффикс -ин указывает на принадлежность, на прямого потомка. В русской ономастике такая модель типична для фамилий, образованных от личных имён и прозвищ, оканчивающихся на -а или -я. Семакин буквально означает «сын Семаки». Подобных фамилий, построенных по той же схеме, много: Ивашкин, Васькин, Петькин, и Семакин стоит в этом ряду.

Имя Симеон было широко распространено на Руси, и его производных форм существовало великое множество. Помимо Семаки, в ходу были Семак, Семейка, Сема, Сёма. Из них выросли фамилии Семаков, Семейкин, Сёмин, Семин. Семака — это уменьшительно-ласкательный вариант, который звучал тепло и по-домашнему, и именно он закрепился в фамилии. Любопытно, что имя Семака встречалось не только в крестьянской среде, но и среди служилых людей, что отражает общую картину бытования фамилии в разных слоях общества.

Встречается и другая версия, менее вероятная: Семака могло быть прозвищем, образованным от глагола «семенить» — ходить мелкими шагами, или от слова «семя» в переносном смысле. Однако для фамилии, закрепившейся в XVI–XVII веках, гораздо естественнее опираться на личное имя, тем более что форма Семака документально зафиксирована как производная от Симеона.

Фамилия Семакин распространена в центральной России и Поволжье, встречается в старинных переписных книгах. Носители её — потомки тех самых людей, которых когда-то звали Семаками, и в каждом из них живёт память о древнем имени с глубоким смыслом: «услышанный Богом».