Фамилия Семечкина — женская форма фамилии Семечкин, и её происхождение напрямую связано с миром растений, хотя не всё так очевидно, как кажется на первый взгляд. Основа фамилии — слово «семечко». Но в русской ономастике редко, когда прозвище давали по мелкому предмету без веской причины. Скорее всего, Семечкиным называли не просто любителя подсолнухов, а человека, связанного с торговлей или производством семян — например, крестьянина, который выращивал на продажу мак, подсолнечник или лён, или же мелкого торговца-коробейника, торговавшего семечками на ярмарках.

Менее распространённая, но лингвистически возможная версия отсылает к личному имени Семён. В народной речи уменьшительные формы «Сема», «Семечка» могли давать не только детям, но и взрослым — как ласковое или ироничное прозвище. Тогда Семечкин — это буквально «сын Семёна», а Семечкина — его дочь или жена. Однако эта версия слабее: суффикс -к- в основе (Семечк-) характерен именно для предметных прозвищ, а не для патронимических форм, где чаще встречается Семёнов или Семин.

Словообразовательная модель типична для русского севера и центральных губерний: основа на -к- плюс суффикс -ин, указывающий на принадлежность. Фамилия Семечкина недвусмысленно женская, но в исторических документах (ревизских сказках, метриках) её носительницы могли записываться и как Семечкины, без изменения окончания, что зависело от грамотности писаря. Географически фамилия встречается рассеянно, без ярко выраженного гнезда, что говорит о её прозвищном, а не сословном происхождении — Семечкины могли быть и крестьянами, и мещанами, и купцами, но никогда не принадлежали к титулованному дворянству.

Если сравнивать с однокоренными фамилиями вроде Семенов, Семаков или Семушкин, то Семечкина стоит особняком: у неё нет отчётливого религиозного или календарного оттенка, зато есть лёгкий отпечаток народного быта, рынка и повседневной торговли. В дореволюционной России такую фамилию могли дать не по документам, а по уличному прозвищу, которое со временем закрепилось официально.