В основу фамилии Семеген, скорее всего, легла производная форма крестильного имени Семен (Симеон) — Семега. Это имя в переводе с древнееврейского означает «услышавший». Согласно другой гипотезе, фамилия Семеген образована от прозвища Семега, которое, в свою очередь, восходит к нарицательному «семеряга». Так называли домотканое грубое некрашенное сукно и верхнюю крестьянскую одежду из такого сукна. Выпадение слога «ря» в данном случае объясняется фонетическими процессами в языке. Исходя из этого, можно предположить, что прозвище Семега относится к так называемым «профессиональным» именованиям и указывает на род деятельности предка: вероятно, он был портным. Менее вероятно, что фамилия связана с топонимом Семег. Это город, расположенный на севере Венгрии. В таком случае основатель рода Семеген мог состоять на службе в этих местах. Фамилия Семеген образовалась при помощи суффикса -ен. Поэтому Семеген буквально понималось как «сын Семеги». Позднее древний суффикс -ен утратил свое прямое значение и сохранился лишь в качестве фамильного.