Фамилия Семионкина — женская форма, а мужская, Семионкин, образована от имени Семионка. Это уменьшительно-ласкательный вариант крестильного имени Семион, которое в свою очередь является народной русской формой канонического имени Симеон. В православных святцах имя Симеон восходит к древнееврейскому Шимон — «услышанный Богом». Так что в основе фамилии лежит не редкое, а одно из самых распространенных библейских имен, но в своей просторечной, «домашней» огласовке.

Особенность фамилии — суффикс -ин, который в русской модели указывает на принадлежность: «чей?» — Семионкин, то есть сын или потомок Семионки. В отличие от фамилий на -ов/-ев, которые чаще встречались у великорусского крестьянства центральных губерний, фамилии на -ин характерны для северных и северо-восточных земель (Архангельская, Вологодская, Вятская губернии), а также для донского казачества. Впрочем, географию фамилии Семионкина сегодня определить сложно: она довольно редкая, и в современных справочниках массово не встречается.

Интересно, что форма Семион, а не Семён, выдает диалектную или старую письменную традицию. В XVIII–XIX веках имя Семион нередко фиксировалось в документах как «полуцерковный» вариант, наряду с простонародным Семён. Таким образом, предок носительницы фамилии мог быть записан в метрике именно как Семион — или же Семионкой его звали в кругу семьи, чтобы отличать от других Семёнов. Прозвищное происхождение здесь маловероятно: имя, а не прозвище.

Однокоренные фамилии — Семёнов, Сёмин, Семионов, Семинкин. Семионкина стоит в этом ряду как самая редкая и выразительная форма, сохранившая архаичное звучание имени.