Фамилия Сепету — редкий случай, когда написание почти полностью совпадает с произношением, а сама фамилия не вписывается в стандартные русские словообразовательные модели. Она не оканчивается на -ов, -ин, -ский или -их, что сразу указывает на её нерусское или позднее происхождение. Скорее всего, перед нами фамилия, закреплённая в письменном виде без русификации, то есть без добавления типичного суффикса принадлежности.

Корень «сепет» отсылает к тюркским языкам. В турецком, крымскотатарском и гагаузском «sepet» означает «корзина». Прозвище Сепету могли дать человеку, который плёл корзины, торговал ими или, в переносном смысле, был запасливым и хозяйственным. Окончание на -у характерно для фамилий, записанных в тюркоязычной среде, где оно могло быть падежным окончанием (например, «из рода Сепета») или просто фиксированной формой прозвища. Встречается такой тип фамилий у гагаузов, кумыков и народов Северного Кавказа.

Другая, менее вероятная версия — происхождение от румынского или молдавского «sepet» (в тех же значениях) через украинское или бессарабское посредничество. В этом случае фамилия могла появиться на юго-западе Российской империи, в Бессарабской губернии, где смешивались молдавские, украинские и тюркские говоры. Однако в румынском слово «sepet» — заимствование из турецкого, так что первичным всё равно оказывается тюркский источник.

По суффиксу и окончанию фамилия не даёт подсказок о сословии предков: такую форму могли зафиксировать и у крестьянина-ремесленника, и у мещанина. В документах XIX — начала XX века Сепету встречаются среди переселенцев из Новороссии и Крыма, а также в записях гагаузских колоний Буджака. Если ваши предки носили эту фамилию, стоит обратить внимание на южные регионы бывшей Российской империи — от Одессы до Ставрополья.