Фамилия Септа — редкий случай, когда основа не даёт однозначного ответа, и это делает её особенно интересной для разбора. В русской ономастике нет устоявшейся модели, по которой её можно было бы сразу отнести к какому-то одному источнику, поэтому придётся рассмотреть несколько версий, от самых вероятных до экзотических.

Первое, что бросается в глаза — фамилия не имеет типичного русского суффикса (-ов, -ев, -ин). Это значит, что она, скорее всего, либо застыла в форме чистой основы (как, например, фамилии Сорока или Голова), либо является иноязычной по происхождению. Самая правдоподобная версия связывает её с латинским словом septum — «перегородка» или «ограда». В этом случае фамилия могла быть прозвищем строителя, плотника или человека, жившего у заметной ограды. Однако вряд ли крестьянину в глухой русской деревне дали бы латинское прозвище — скорее, это книжное, семинарское происхождение. В духовных училищах XVIII–XIX веков ученикам часто давали фамилии от латинских или греческих слов, и «Септа» могла стать такой «искусственной» фамилией для выходца из духовного сословия.

Другая, не менее интересная версия — географическая. Фамилия могла возникнуть от названия населённого пункта. Например, во Франции есть коммуна Септ (Sept), в Италии — Септа (Sépta), а в Латвии — волость Септа. Если предки носителя фамилии были выходцами из Прибалтики или Западной Европы, то фамилия могла быть адаптирована на русской почве без изменений. В пользу этого говорит и то, что суффикс -а на конце характерен для многих западных фамилий, которые «обрусели» в звучании, но сохранили исходную форму.

Третья, менее вероятная версия — от древнегреческого слова septos (σεπτός), означающего «почтенный» или «святой». Это могло быть личное имя или прозвище, данное в религиозной среде. Однако для русского уха такое звучание непривычно, и эта гипотеза остаётся скорее догадкой, чем доказанным фактом.

С точки зрения географии, фамилия Септа не является массовой. В современных российских базах она встречается точечно — в основном на юге страны, в Краснодарском крае и Ростовской области, а также в Сибири. Это может указывать на позднее переселение носителей или на то, что фамилия была принесена в эти регионы в XIX–XX веках. Встречается она и у еврейских семей, где могла быть образована от аббревиатуры или быть вариантом фамилии Септер (от названия города Сепетин).

Итог: перед нами фамилия-загадка, скорее всего, искусственного или заимствованного происхождения. Человек с фамилией Септа с высокой вероятностью имеет предков либо из духовного сословия, получивших «латинскую» фамилию в семинарии, либо из переселенцев с запада. Ни одна из версий не является стопроцентно доказанной, но именно это отсутствие шаблона и делает фамилию непохожей на другие.