Фамилия Серкенова — женская форма, соответствующая мужской Серкенов. Её основа — личное имя или прозвище Серкен. Разбирая словообразовательную модель, видим типичный для русских фамилий суффикс -ов, указывающий на принадлежность: «чей?» — Серкенов, то есть сын или потомок Серкена.

Корень «Серкен» — не русский и не славянский. Скорее всего, фамилия тюркского происхождения. В тюркских языках (казахском, башкирском, татарском, ногайском) существует имя Серкен или близкие ему формы. Оно может восходить к слову «серке» — так называют козла-вожака, предводителя стада. В переносном смысле — «вожак», «главарь», «упрямец». Либо имя образовано от «сер» — «голова», «верх» и «кен» — «широкий», «просторный», что в сумме может означать «широкий лбом» или «большеголовый» — прозвище по внешнему признаку.

В ономастике фамилии на -ов от тюркских имён — обычное явление в Поволжье, на Урале, в Казахстане и среди народов Северного Кавказа. Серкеновы могли быть потомками человека по имени Серкен, который жил в среде, где русская фамильная модель накладывалась на местную именную традицию. Сословно это могли быть как казаки, так и крестьяне или служилые люди — точных данных нет, но ареал бытования фамилии (юг России, Приуралье, Казахстан) подсказывает, что предки Серкеновых, скорее всего, были тюркоязычными кочевниками или полукочевниками, чьи потомки затем обрусели.

Интересная деталь: в отличие от фамилий с корнем «Серге-» (от Сергей), Серкенова не имеет отношения к христианским именам. Это редкий случай, когда основа не адаптировалась через крестильное имя, а сохранила исконное тюркское звучание. Похожие по модели фамилии — Серкебаев, Серкешов, Серкеров — встречаются в казахской и башкирской среде, что подтверждает общий источник.