Фамилия Серкенов — редкий случай в русском ономастиконе. Её основа не славянская, а тюркская, что сразу указывает на географию происхождения: скорее всего, предки носителя этой фамилии жили в Поволжье, на Урале, в Казахстане или Средней Азии. Разбираем словообразовательную модель: фамилия образована по русскому патронимическому шаблону «-ов», который присоединили к тюркскому личному имени или прозвищу Серкен (Серкен, Серкенбай и т.п.).

Само имя Серкен, вероятнее всего, восходит к казахскому или татарскому «серкен» — так называют крупного козла-вожака в стаде, от которого ждут потомства. В переносном смысле — «вожак», «предводитель», «глава рода». Мужчина, получивший такое прозвище, мог быть либо владельцем большого стада, либо человеком с лидерскими качествами, которого уважали в общине. Менее вероятная, но возможная версия — связь с арабским «саркар» (начальник) через диалектные искажения, но она слабее, так как «серкен» как «козел-производитель» зафиксирован в тюркских языках устойчиво.

Фамилия не входит в число распространённых, её носители встречаются в основном в Казахстане, Башкортостане, Татарстане, а также среди казахов, живущих в России. В дореволюционных метрических книгах и ревизских сказках она почти не попадается, что говорит о позднем оформлении — скорее всего, в конце XIX — начале XX века, когда у кочевых и полукочевых народов начали массово фиксировать фамилии по отчеству. Суффикс «-ов» вместо тюркского «-улы» или «-кызы» — прямое свидетельство русификации при записи в документы.

С точки зрения социального статуса, предки Серкеновых, скорее всего, были скотоводами или мелкими родоправителями, но не знатного происхождения — тюркская аристократия обычно получала фамилии на «-ев» от имён с титулами (бий, хан, султан). Здесь же основа бытовая, хозяйственная.