Фамилия Сетйкина — женская форма фамилии Сетйкин, а та, в свою очередь, образована от прозвища Сетйка. Это нестандартная модель: не от имени через суффикс принадлежности, а напрямую от прозвища с «уменьшительным» -к-, которое затем оформилось фамильным суффиксом -ин. Такое словообразование характерно для северных и восточных регионов России, где прозвища легко превращались в фамилии без промежуточных этапов.

Основа — «сетйк» — скорее всего, вариант слова «сетик» или «сетка». В диалектах русского языка сеткой называли мелкую рыбацкую сеть, а сетником — рыбака, который ставит сети. Прозвище Сетйка могли дать человеку, связанному с рыболовством: либо рыбаку, либо тому, кто плел сети, либо тощему, «сетчатому» человеку. Вторая версия — от глагола «сетить» (ставить сети) или «сетовать» (жаловаться), но она менее вероятна, так как прозвища от действий чаще образуются через -л- (Сетила), а не через -к-.

Фамилия редкая, с характерным для Вологодской и Архангельской губерний суффиксом -ин при основе на -к-. В справочниках по ономастике (например, у Б. Унбегауна) модель «прозвище на -ка + -ин» описывается как типичная для северных говоров, где фамилии фиксировались раньше и в более «народной» форме. Сетйкины могли быть крестьянами-рыбаками или мастерами по плетению сетей — промысел на Севере был основным. В отличие от фамилий вроде Сеткин (от сетка как одежда), здесь сохранился йот, что указывает на диалектное произношение: «сетй-» вместо «сет-».

Поскольку фамилия встречается редко, её носители, скорее всего, сосредоточены в тех же северных регионах или в Сибири, куда переселялись поморы. Дворянских родов с такой фамилией не зафиксировано — это однозначно крестьянская или посадская фамилия, возникшая в среде, где человека называли по ремеслу или внешности.