Фамилия Сейткужанова, скорее всего, образована от имени Сейткужан, состоящего из двух частей: «сейт» и «кужан». Первая из них представляет собой фонетический вариант арабского существительного «саит» со значением «руководитель, властелин», а также «счастливый, удачный». Титул саит давали роду, берущему начало от детей дочери пророка Мухаммета Фатимы. Вторая часть имени Сейткужанова, предположительно, восходит к нарицательному «кужан». Так называли одно из родовых древнетюркских подразделений. Кроме того, «кужан» в переводе с коми означает «умелый». Таким образом, именование Сейткужан можно трактовать как «повелитель кужан» или «умелый господин». Таким образом, потомок человека, которого звали Сейткужан, со временем получил фамилию Сейткужанов. Тюркский корень -огло/-оглу/-оглы (в переводе «потомок, сын») типичен для турецких, гагаузских и прочих тюркских фамилий.