Фамилия Сейтмагамбетов — яркий пример того, как русская словообразовательная модель наложилась на арабское имя, пройдя через тюркское посредничество. Корень здесь — двусоставное мужское имя Сейтмагамбет, которое в свою очередь распадается на две части: «Сейт» (арабское «саййид» — господин, потомок пророка) и «Магамбет» — один из тюркских вариантов произношения имени Мухаммед. Таким образом, имя Сейтмагамбет означает «господин Мухаммед» или «потомок пророка Мухаммеда», что указывает на высокий религиозный статус.

Суффикс -ов превращает это имя в фамилию по стандартной русской модели, отвечая на вопрос «чей?». Сейтмагамбетов — буквально «сын (или потомок) Сейтмагамбета». Фамилия типична для народов, исповедующих ислам, в первую очередь для казахов, где она широко распространена в западных и южных регионах. Носители этой фамилии — потомки человека, которого звали Сейтмагамбет, и, вероятно, в его роду ценили связь с религиозной традицией.

В отличие от многих фамилий, образованных от уменьшительных или обиходных форм, эта сохраняет полное, почтительное имя. Это говорит о том, что предок, давший фамилию, пользовался особым уважением в общине — возможно, был аксакалом, муллой или просто человеком, чьё имя не редуцировали до сокращённого варианта. Встречается и вариант написания Сейтмагамбетов с буквой «е» после «т» — это результат адаптации казахского произношения к русской графике.

С точки зрения этимологии, фамилия уникальна тем, что совмещает в себе сразу два арабских корня с сакральным значением, что делает её своего рода «двойным благословением» в имени. Аналогов в русском ономастиконе практически нет, за исключением, возможно, фамилий вроде Магомедов, но здесь приставка «Сейт» добавляет оттенок аристократизма происхождения.